重庆医科大学继续教育办学早、历史悠久，始于1960年开办的医学专业成人本科夜大班，至今60余年。上世纪八十年代，学校成立成人教育处，2002年成立应用技术学院。2007-2010年学校因改革、发展需要，撤销应用技术学院，原有成人教育的教学与学生管理逐步随普通本科教育分流归口，实施大教务、大学工与院系管理三者相互独立又相互协同的综合管理模式。2019年继续教育学院定编，为适应社会发展及学校继续教育工作需要，2023年12月启用继续教育学院。

继续教育学院位于袁家岗校区，是学校的二级单位，内设学院办公室、教务与学生管理科、培训科三个科室。主要承担高等学历继续教育和非学历继续教育工作，学院充分依托学校的、专业、师资等办学优势，立足重庆、服务行业，致力培养服务西南地区卫生健康事业发展的复合型、应用型医学人才。

现有临床医学、医学检验技术、护理学、中西医临床医学、药学等5个高等学历继续教育专升本招生专业，主要以提高在职医疗人员的专业素质、满足卫生事业的发展、满足新时代人们对医疗卫生服务的更高要求为办学目标。学校举办高等学历继续教育60多年来，培养了数万名学生，为重庆地区及西部的经济建设和医疗卫生建设培养了一大批基层医疗卫生人才，提高了基层单位专业素质及服务能力，为推进健康中国战略、提高西部地区医疗服务水平具有重要的促进作用。

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